L'IRCCS Centro Neurolesi Bonino Pulejo Istituto di Ricovero e Cura a Carattere Scientifico e si caratterizza come ospedale di alta specializzazione e di rilievo nazionale nel settore della neuroriabilitazione. Persegue, secondo standard d'eccellenza, finalità di ricerca nel campo biomedico ed in quello dell'organizzazione dei servizi sanitari, di innovazione nei modelli d'assistenza e di trasferimento delle conoscenze, unitamente a prestazioni di ricovero e cura di alta qualificazione a pazienti con gravi cerebrolesioni acquisite, patologie neurodegenerative e demielinizzanti. In quanto IRCCS il Centro Neurolesi Bonino Pulejo ha nella ricerca una sua missione fondamentale, sia rispetto al Servizio Sanitario Nazionale sia rispetto al sistema regionale di ricerca. Gli IRCCS sono enti di rilevanza nazionale che secondo standards di eccellenza, perseguono finalità di ricerca, prevalentemente clinica e traslazionale, nel campo biomedico ed in quello dell'organizzazione dei servizi sanitari, unitamente a prestazioni di ricovero e cura di alta intensità (dl 288/2003).

La Commissione Nazionale Ricerca Sanitaria del Ministero della Salute ha recentemente definito i tre obiettivi essenziali della ricerca svolta dagli IRCCS:
a) Ricerca innovativa volta allo sviluppo di nuove tecnologie diagnostiche e terapeudiche
b) Ricerca valutativa, volta alla sperimentazione e valutazione delle tecnologie e dei modelli assistenziali.
c) Ricerca orientata alle problematiche socio sanitarie emergenti, volta allo studio epidemiologico e alla definizione di strategie preventive di popolazione.
In questo ambito l'IRCCS Centro Neurolesi Bonino Pulejo persegue le proprie finalità scientifiche.